Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GKAP1Q5VSY0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GKAP1Q5VSY0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms