Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBAP2Q5T6F2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBAP2Q5T6F2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBAP2Q5T6F2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBAP2Q5T6F2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms