Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CELF3Q5SZQ8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms