Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
FRMPD1Q5SYB0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms