Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LDLRAP1Q5SW96 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms