Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK2Q5EBM0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms