Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q56UQ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q56UQ5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms