Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms