Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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