Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC142Q17RM4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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