Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CDO1Q16878 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDO1Q16878 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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