Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1FQ16864 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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