Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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ATP6AP1Q15904 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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