Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP1Q15431 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms