Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNN3Q15417 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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