Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3B3Q15393 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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