Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
IRF4Q15306 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IRF4Q15306 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms