Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX1-1Q15270 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms