Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KARSQ15046 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KARSQ15046 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KARSQ15046 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KARSQ15046 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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