Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NWD1Q149M9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NWD1Q149M9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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