Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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