Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
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