Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP1Q13835 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP1Q13835 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms