Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCOA4Q13772 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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