Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BFSP2Q13515 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BFSP2Q13515 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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