Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLAMF1Q13291 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms