Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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