Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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IFT88Q13099 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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