Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms