Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK2Q13002 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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