Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPRL3Q12980 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPRL3Q12980 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPRL3Q12980 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPRL3Q12980 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPRL3Q12980 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPRL3Q12980 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPRL3Q12980 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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NPRL3Q12980 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NPRL3Q12980 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPRL3Q12980 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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