Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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FOXF1Q12946 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF1Q12946 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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