Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCAPQ12770 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCAPQ12770 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCAPQ12770 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCAPQ12770 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCAPQ12770 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCAPQ12770 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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