Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 snR54snR54 86 nt0.83□□□□□ -2.28
SME1Q12330 LAA1YJL207C 6045 nt0.83□□□□□ -2.28
SME1Q12330 SMC1YFL008W 3678 nt0.83□□□□□ -2.28
SME1Q12330 ALY2YJL084C 3141 nt0.82□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YOR199WYOR199W 330 nt0.82□□□□□ -2.28
SME1Q12330 RPB10YOR210W 213 nt0.82□□□□□ -2.28
SME1Q12330 SIP4YJL089W 2490 nt0.82□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YJR003CYJR003C 1560 nt0.82□□□□□ -2.28
SME1Q12330 NUP157YER105C 4176 nt0.82□□□□□ -2.28
SME1Q12330 RIM20YOR275C 1986 nt0.81□□□□□ -2.28
SME1Q12330 ECL1YGR146C 636 nt0.81□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YKL202WYKL202W 582 nt0.81□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YLR171WYLR171W 390 nt0.81□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YLR287CYLR287C 1068 nt0.81□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YGR130CYGR130C 2451 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 COG4YPR105C 2586 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YDL011CYDL011C 324 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 HCH1YNL281W 462 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YNL303WYNL303W 348 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.8□□□□□ -2.28
SME1Q12330 CLU1YMR012W 3834 nt0.79□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YPR117WYPR117W 7470 nt0.79□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.79□□□□□ -2.28
SME1Q12330 ERP4YOR016C 624 nt0.79□□□□□ -2.28
SME1Q12330 BEM2YER155C 6504 nt0.79□□□□□ -2.28
SME1Q12330 MSH3YCR092C 3057 nt0.79□□□□□ -2.28
SME1Q12330 DIE2YGR227W 1578 nt0.79□□□□□ -2.28
SME1Q12330 WAR1YML076C 2835 nt0.78□□□□□ -2.28
SME1Q12330 RTT102YGR275W 474 nt0.78□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YJL135WYJL135W 318 nt0.78□□□□□ -2.28
SME1Q12330 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.78□□□□□ -2.28
SME1Q12330 TOM22YNL131W 459 nt0.77□□□□□ -2.29
SME1Q12330 snR41snR41 95 nt0.77□□□□□ -2.29
SME1Q12330 snR72snR72 98 nt0.76□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YDL196WYDL196W 330 nt0.76□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YGR042WYGR042W 816 nt0.76□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YAR009CYAR009C 3591 nt0.75□□□□□ -2.29
SME1Q12330 GEA2YEL022W 4380 nt0.75□□□□□ -2.29
SME1Q12330 CBS1YDL069C 690 nt0.75□□□□□ -2.29
SME1Q12330 GPG1YGL121C 381 nt0.75□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YLR101CYLR101C 396 nt0.75□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.75□□□□□ -2.29
SME1Q12330 IFH1YLR223C 3258 nt0.74□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.74□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YOL160WYOL160W 342 nt0.74□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YPL229WYPL229W 621 nt0.74□□□□□ -2.29
SME1Q12330 snR51snR51 107 nt0.74□□□□□ -2.29
SME1Q12330 SCC2YDR180W 4482 nt0.74□□□□□ -2.29
SME1Q12330 PKH2YOL100W 3246 nt0.74□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.73□□□□□ -2.29
SME1Q12330 LOA1YPR139C 903 nt0.73□□□□□ -2.29
SME1Q12330 ROM2YLR371W 4071 nt0.73□□□□□ -2.29
SME1Q12330 SWF1YDR126W 1011 nt0.72□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YHL041WYHL041W 450 nt0.72□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YKL083WYKL083W 615 nt0.72□□□□□ -2.29
SME1Q12330 PAU24YBR301W 363 nt0.72□□□□□ -2.29
SME1Q12330 RKR1YMR247C 4689 nt0.72□□□□□ -2.29
SME1Q12330 YDL032WYDL032W 312 nt0.71□□□□□ -2.3
SME1Q12330 SDH7YDR511W 402 nt0.71□□□□□ -2.3
SME1Q12330 UBC7YMR022W 498 nt0.71□□□□□ -2.3
SME1Q12330 IES4YOR189W 351 nt0.71□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YPL261CYPL261C 309 nt0.71□□□□□ -2.3
SME1Q12330 RAD34YDR314C 2079 nt0.7□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YAR047CYAR047C 321 nt0.7□□□□□ -2.3
SME1Q12330 RPL26AYLR344W 384 nt0.7□□□□□ -2.3
SME1Q12330 TTI1YKL033W 3117 nt0.69□□□□□ -2.3
SME1Q12330 DBP6YNR038W 1890 nt0.69□□□□□ -2.3
SME1Q12330 PAN2YGL094C 3348 nt0.69□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YAP6YDR259C 1152 nt0.69□□□□□ -2.3
SME1Q12330 ALG13YGL047W 609 nt0.69□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YML003WYML003W 873 nt0.69□□□□□ -2.3
SME1Q12330 ATP19YOL077W-A 207 nt0.69□□□□□ -2.3
SME1Q12330 PCF11YDR228C 1881 nt0.68□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.68□□□□□ -2.3
SME1Q12330 REV3YPL167C 4515 nt0.68□□□□□ -2.3
SME1Q12330 PAC1YOR269W 1485 nt0.67□□□□□ -2.3
SME1Q12330 INP2YMR163C 2118 nt0.67□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YNL058CYNL058C 951 nt0.67□□□□□ -2.3
SME1Q12330 SEC1YDR164C 2175 nt0.67□□□□□ -2.3
SME1Q12330 ISD11YER048W-A 285 nt0.66□□□□□ -2.3
SME1Q12330 BUD3YCL014W 4911 nt0.66□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YDL073WYDL073W 2955 nt0.66□□□□□ -2.3
SME1Q12330 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.65□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YHL042WYHL042W 453 nt0.65□□□□□ -2.31
SME1Q12330 ISF1YMR081C 1017 nt0.65□□□□□ -2.31
SME1Q12330 MRPL50YNR022C 420 nt0.65□□□□□ -2.31
SME1Q12330 CUL3YGR003W 2235 nt0.65□□□□□ -2.31
SME1Q12330 BFR2YDR299W 1605 nt0.64□□□□□ -2.31
SME1Q12330 IML1YJR138W 4755 nt0.64□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.64□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.64□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YIR044CYIR044C 186 nt0.63□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YDR344CYDR344C 444 nt0.62□□□□□ -2.31
SME1Q12330 MAM33YIL070C 801 nt0.62□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YOR282WYOR282W 321 nt0.62□□□□□ -2.31
SME1Q12330 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.61□□□□□ -2.31
SME1Q12330 RPS24BYIL069C 408 nt0.61□□□□□ -2.31
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