Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 snR38snR38 95 nt4.32□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt4.32□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt4.31□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 ARO80YDR421W 2853 nt4.31□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 CDC60YPL160W 3273 nt4.31□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt4.3□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 YGR051CYGR051C 324 nt4.3□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 EST1YLR233C 2100 nt4.29□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 ALA1YOR335C 2877 nt4.29□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 SPO22YIL073C 2928 nt4.28□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 MGM1YOR211C 2646 nt4.28□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 SCD5YOR329C 2619 nt4.28□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 YPR022CYPR022C 3402 nt4.28□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt4.28□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 NIP1YMR309C 2439 nt4.28□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 CHD1YER164W 4407 nt4.28□□□□□ -1.72
TSR3Q12094 TAE2YPL009C 3117 nt4.27□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 PRP6YBR055C 2700 nt4.26□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 FIR1YER032W 2631 nt4.26□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 DCP2YNL118C 2913 nt4.26□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 NOP14YDL148C 2433 nt4.25□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 APL4YPR029C 2499 nt4.25□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 RAD2YGR258C 3096 nt4.25□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 RSM22YKL155C 1887 nt4.24□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 RAD4YER162C 2265 nt4.24□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 PDR12YPL058C 4536 nt4.24□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt4.24□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 SCP160YJL080C 3669 nt4.24□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 ULS1YOR191W 4860 nt4.24□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 MYO5YMR109W 3660 nt4.24□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 AZF1YOR113W 2745 nt4.23□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 ARP8YOR141C 2646 nt4.23□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 POL5YEL055C 3069 nt4.22□□□□□ -1.73
TSR3Q12094 APE2YKL157W 2859 nt4.21□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 YLR278CYLR278C 4026 nt4.21□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 EPL1YFL024C 2499 nt4.2□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 SSM4YIL030C 3960 nt4.2□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 SPT23YKL020C 3249 nt4.19□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt4.19□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 FLO10YKR102W 3510 nt4.17□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 COA6YMR244C-A 315 nt4.17□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 CDC53YDL132W 2448 nt4.17□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 YDR186CYDR186C 2634 nt4.17□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 SEC21YNL287W 2808 nt4.17□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 YDL073WYDL073W 2955 nt4.16□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 IES6YEL044W 501 nt4.16□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 PET127YOR017W 2403 nt4.16□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 SPT6YGR116W 4356 nt4.16□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 SDC25YLL016W 3147 nt4.15□□□□□ -1.74
TSR3Q12094 NUP133YKR082W 3474 nt4.15□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 YPR097WYPR097W 3222 nt4.15□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 SLI15YBR156C 2097 nt4.14□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt4.14□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 TRS120YDR407C 3870 nt4.14□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 FLO9YAL063C 3969 nt4.14□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 BCK2YER167W 2556 nt4.13□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 GCV2YMR189W 3105 nt4.13□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 OSH3YHR073W 2991 nt4.13□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 RPO21YDL140C 5202 nt4.13□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 TAF1YGR274C 3201 nt4.12□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 YGL140CYGL140C 3660 nt4.12□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 HMG1YML075C 3165 nt4.12□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.12□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 SWI1YPL016W 3945 nt4.12□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 TCB3YML072C 4638 nt4.11□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 SNF2YOR290C 5112 nt4.11□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 GSC2YGR032W 5688 nt4.11□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 PIK1YNL267W 3201 nt4.1□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 SLA1YBL007C 3735 nt4.1□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 ISW1YBR245C 3390 nt4.1□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 XRN1YGL173C 4587 nt4.09□□□□□ -1.75
TSR3Q12094 YML054C-AYML054C-A 159 nt4.08□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 ADR1YDR216W 3972 nt4.07□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 RPO31YOR116C 4383 nt4.07□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 CAF120YNL278W 3183 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 SIP4YJL089W 2490 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 SIZ1YDR409W 2715 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 VMR1YHL035C 4779 nt4.06□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 TRK1YJL129C 3708 nt4.05□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 STE23YLR389C 3084 nt4.04□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 EMC1YCL045C 2283 nt4.04□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 BEM3YPL115C 3387 nt4.03□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 MSH5YDL154W 2706 nt4.03□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 RAD26YJR035W 3258 nt4.03□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 MRD1YPR112C 2664 nt4.03□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 TRM3YDL112W 4311 nt4.03□□□□□ -1.76
TSR3Q12094 RGA1YOR127W 3024 nt4.03□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 MYO2YOR326W 4725 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 ALY2YJL084C 3141 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 TRS130YMR218C 3309 nt4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms