Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBRQ0VD83 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms