Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms