Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLFN5Q08AF3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms