Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP3CAQ08209 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP3CAQ08209 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP3CAQ08209 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP3CAQ08209 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP3CAQ08209 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP3CAQ08209 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms