Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL9Q07325 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCL9Q07325 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms