Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNDQ07001 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNDQ07001 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms