Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms