Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF8Q02556 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms