Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OC90Q02509 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OC90Q02509 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OC90Q02509 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OC90Q02509 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OC90Q02509 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms