Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN7AQ01118 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN7AQ01118 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms