Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD3P84022 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD3P84022 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms