Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC1P78348 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms