Protein–RNA interactions for Protein: P78318

IGBP1, Immunoglobulin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGBP1P78318 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGBP1P78318 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGBP1P78318 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms