Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB4BP68371 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB4BP68371 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB4BP68371 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB4BP68371 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms