Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP1P63208 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP1P63208 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP1P63208 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP1P63208 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKP1P63208 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKP1P63208 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms